Theo kết quả kiểm định độc lập của Công ty Tư vấn đường bộ 2 (Tecco2), chỉ sau một thời gian rất ngắn đưa vào khai thác đã có tới 3/8 gói thầu xây lắp chính của Dự án đã bị hư hỏng rất nặng, như mặt đường bị rạn nứt, cốt liệu lộ nhiều trên mặt, mặt đường bị bong tróc... Thanh tra Bộ GTVT kiến nghị Bộ GTVT ra quyết định cấm Công ty TNHH Tư vấn và Xây dựng công trình 747 và Chi nhánh Công ty CP Đầu tư xây dựng số 10 - Xí nghiệp Tư vấn thiết kế tham gia đấu thầu về tư vấn giám sát các dự án trong ngành GTVT trong vòng 18 tháng. Công ty TNHH Tư vấn và Xây dựng công trình 747 bị phạt 209 triệu đồng; Công ty CP Tư vấn đầu tư xây dựng Cần Thơ bị phạt 153 triệu đồng.