Theo Thứ trưởng Nguyễn Thị Xuyên, sau 3 năm triển khai thực hiện, Luật BHYT đã tác động tích cực đến chính sách BHYT tại Việt Nam. Tuy nhiên, việc tổ chức thực hiện Luật BHYT đang gặp nhiều tồn tại, vướng mắc do những quy định trong Luật chưa phù hợp. Đặc biệt, tỷ lệ bao phủ BHYT tuy tăng nhưng còn thấp, tính tuân thủ pháp luật về BHYT chưa cao. Khu vực doanh nghiệp mới có 53% người lao động tham gia BHYT; người thuộc hộ cận nghèo dù đã được ngân sách hỗ trợ 70% mức đóng nhưng cũng chỉ đạt 20% số người tham gia; đối tượng tự nguyện tham gia BHYT còn thấp hơn, chỉ đạt 25%, dẫn đến tình trạng chỉ có người ốm, mới tham gia BHYT.
