Đáng lo ngại nhất là muỗi truyền bệnh đã kháng hóa chất. TS. Trần Thanh Dương, Phó Cục trưởng Cục Y tế dự phòng - Bộ Y tế cho biết, loài muỗi truyền bệnh SXH phổ biến hiện nay là muỗi Aedes aegypti. Tuy nhiên, thời gian qua nhiều địa phương phun hóa chất chưa hiệu quả, không đảm bảo kỹ thuật nên dẫn đến hiện tượng muỗi kháng lại hóa chất. Kết quả thử tính kháng hóa chất của muỗi truyền bệnh SXH dengue tại 11 tỉnh, thành phố với 3 loại hóa chất Deltamethrin, Malathion và Permethrin cho thấy, chỉ có Malathion là còn tác dụng.