Trạm thu phí Phù Đổng – QL1 được Chính phủ giao cho VEC quản lý thu phí để bổ sung vào nguồn vốn điều lệ của VEC. Trên cơ sở này, VEC đã ký hợp đồng chuyển giao quyền thu phí với ICID trong thời gian 57 tháng, kể từ thời điểm 1-4-2010 và kết thúc vào 31-12-2014. Tuy nhiên, theo chỉ đạo của Chính phủ về sắp xếp các trạm thu phí khi Quỹ bảo trì đường bộ đi vào hoạt động, Trạm thu phí Phù Đổng nằm trong diện phải dừng hoạt động thu phí trước thời hạn hợp đồng.
Trước đó, Thủ tướng Chính phủ cũng đã giao cho Bộ GTVT xem xét mua lại trạm thu phí Bãi Cháy (Quảng Ninh) và Hoàng Mai (Nghệ An). Đây là hai trạm thu phí sử dụng vốn ngân sách nhưng đã bán quyền.
