Với luận án “Quá trình thực hiện chủ trương Cách mạng ruộng đất của Đảng ở tỉnh Thanh Hóa” (1945-1957) - tác giả Lê Thị Quỳnh Nga đã được trao giải nhất với trị giá 15 triệu đồng. 2 giải nhì, mỗi giải 10 triệu đồng thuộc về luận án “Quá trình xâm nhập của Pháp vào Việt Nam từ cuối thế kỷ XVII đến giữa thế kỷ XIX - Nguyên nhân và hệ quả” và “Đảng bộ tỉnh Bạc Liêu lãnh đạo chuyển dịch cơ cấu kinh tế từ năm 1997-2006” của hai tác giả Nguyễn Mạnh Dũng và Đào Thị Bích Hồng. Quỹ giải thưởng Sử học Phạm Thận Duật được khởi động lần đầu tiên vào năm 2000, nhằm tôn vinh những luận án tiến sĩ Sử học xuất sắc nhất trong năm.
