Trước đó, theo Kết luận số 5442/KL-BGTVT ngày 12-7-2012 của Thanh tra Bộ GTVT cho rằng, việc quy định áp dụng không thống nhất mức thu phí sử dụng lòng đường vỉa hè đối với Công ty Khai thác điểm đỗ xe Hà Nội được tính bằng 2% trên doanh thu hàng năm, các đơn vị còn lại nộp từ 10.000 - 45.000 đồng/m2/tháng tùy theo tuyến phố đã dẫn đến sự thiếu công bằng về nghĩa vụ nộp phí giữa các đơn vị. Từ quy định cho phép nộp theo 2% doanh thu, ước tính gây thất thu cho ngân sách nhà nước hàng năm ở Công ty Khai thác điểm đỗ xe ít nhất từ 20 tỷ đồng.
Theo ông Nguyễn Quốc Hùng, Giám đốc Sở GTVT Hà Nội, việc cấp phép tổ chức thu phí và lệ phí của Sở GTVT đảm bảo theo đúng quyết định của UBND TP. Công ty Khai thác điểm đỗ xe Hà Nội là doanh nghiệp thực hiện nhiệm vụ của thành phố, Sở GTVT thực hiện thu phí theo đúng nghị quyết của HĐND và quyết định của UBND TP. Các khoản thu phải nộp Sở GTVT thực hiện theo đúng pháp luật. Vì vậy, ông Hùng cho rằng, việc Thanh tra Bộ GTVT kết luận thất thoát hơn 20 tỷ đồng mỗi năm do sự chênh lệch trong việc áp phí sử dụng lòng đường là không có cơ sở. Mặt khác, khi tiến hành thanh tra, đoàn công tác của Bộ mới làm việc với Sở GTVT một lần và chưa thu thập đầy đủ các hồ sơ, số liệu cần thiết liên quan đến việc ra kết luận thanh tra…
