Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ chỉ đạo công tác đấu tranh phòng chống, thanh tra, kiểm tra, xử lý vi phạm; phối hợp với cơ quan công an để kịp thời truy tố các tổ chức, cá nhân có sai phạm về nộp thuế GTGT trước pháp luật. Qua đó, sẽ tăng cường việc kiểm điểm, xử lý trách nhiệm của các tổ chức, cá nhân có liên quan của ngành tài chính trong việc để xảy ra sai phạm trong công tác quản lý thu thuế GTGT.