Theo tài liệu điều tra, quá trình điều hành 2 công ty chuyên kinh doanh, vận chuyển xăng dầu, Nguyễn Phước Chánh đã mua phương tiện xà lan tự hành và tàu chở dầu. Sau đó, ông Chánh đã thế chấp số phương tiện này cho ALC II để ký các hợp đồng cho thuê tài chính với tổng số tiền hơn 56 tỷ đồng. Lợi dụng sự thiếu trách nhiệm của một số cán bộ ALC II, ông Chánh không bàn giao đầy đủ giấy tờ cần thiết. Từ tháng 9-2008 đến tháng 1-2009, giám đốc Chánh đã ký 5 hợp đồng cho thuê tài chính, tài sản thuê là 7 tàu chở dầu và xà lan tự hành với ALC II. Sau khi ký, ông Chánh đã tự ý cho thuê lại số xà lan và tàu chở dầu, đồng thời bán trái phép 2 con tàu chở dầu để chiếm đoạt 4,4 tỷ đồng.
Được biết, năm 2011, cơ quan chức năng đã công bố kết quả thanh tra giám sát cho thấy số tiền thiệt hại của ALC II lên đến cả nghìn tỷ đồng. Một số cựu cán bộ lãnh đạo của công ty này đã bị Cơ quan Cảnh sát Điều tra - Bộ Công an khởi tố, bắt tạm giam, trong đó có ông Vũ Quốc Hảo - nguyên Tổng giám đốc.