Ngoài ra, các hành vi vi phạm trong lĩnh vực bảo vệ thực vật đều tăng mức phạt từ 2-3 lần so với quy định cũ. Ví như, phạt tiền từ 5-10 triệu đồng đối với hành vi đưa vào lãnh thổ Việt Nam vật thể thuộc diện kiểm dịch thực vật mà không có giấy chứng nhận kiểm dịch thực vật của nước xuất khẩu. Ngoài ra, sẽ buộc đưa ra khỏi lãnh thổ Việt Nam hoặc buộc tái xuất vật thể. Mức phạt cao nhất đối với cá nhân vi phạm trong lĩnh vực này là 50 triệu đồng (trước kia 30 triệu đồng), với tổ chức là 100 triệu đồng (trước là 30 triệu đồng).
